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  1. Hahnke, Richard L. [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; García-López, Marina [VerfasserIn]; Mukherjee, Supratim [VerfasserIn]; Huntemann, Marcel [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia N. [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]

    Genome-based taxonomic classification of Bacteroidetes

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2016

  2. Bischoff, Vera [VerfasserIn]; Bunk, Boyke [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan Philipp [VerfasserIn]; Spröer, Cathrin [VerfasserIn]; Poehlein, Anja [VerfasserIn]; Dogs, Marco [VerfasserIn]; Nguyen, Mary [VerfasserIn]; Petersen, Jörn [VerfasserIn]; Daniel, Rolf [VerfasserIn]; Overmann, Jörg [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Simon, Meinhard [VerfasserIn]; Brinkhoff, Thorsten [VerfasserIn]; Moraru, Cristina [VerfasserIn]

    Cobaviruses - a new globally distributed phage group infecting Rhodobacteraceae in marine ecosystems

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    2019

    Erschienen in: International Society for Microbial Ecology: The ISME journal ; 13(2019), $p1404-1421

  3. Bischoff, Vera [VerfasserIn]; Bunk, Boyke [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Spröer, Cathrin [VerfasserIn]; Poehlein, Anja [VerfasserIn]; Dogs, Marco [VerfasserIn]; Nguyen, Mary [VerfasserIn]; Petersen, Jörn [VerfasserIn]; Daniel, Rolf [VerfasserIn]; Overmann, Jörg [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Simon, Meinhard [VerfasserIn]; Brinkhoff, Thorsten [VerfasserIn]; Moraru, Cristina [VerfasserIn]

    Cobaviruses – a new globally distributed phage group infecting Rhodobacteraceae in marine ecosystems

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2019

  4. Sikorski, Johannes [VerfasserIn]; Baumgartner, Vanessa [VerfasserIn]; Birkhofer, Klaus [VerfasserIn]; Boeddinghaus, Runa [VerfasserIn]; Bunk, Boyke [VerfasserIn]; Fischer, Markus [VerfasserIn]; Fösel, Bärbel U. [VerfasserIn]; Friedrich, Michael W. [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Hölzel, Norbert [VerfasserIn]; Huang, Sixing [VerfasserIn]; Huber, Katharina J. [VerfasserIn]; Kandeler, Ellen [VerfasserIn]; Klaus, Valentin H. [VerfasserIn]; Kleinebecker, Till [VerfasserIn]; Marhan, Sven [VerfasserIn]; Mering, Christian von [VerfasserIn]; Oelmann, Yvonne [VerfasserIn]; Prati, Daniel [VerfasserIn]; Regan, Kathleen [VerfasserIn]; Richter-Heitmann, Tim [VerfasserIn]

    The evolution of ecological diversity in Acidobacteria

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    2022

    Erschienen in: Frontiers in microbiology ; 13(2022), Artikel-ID 715637, Seite 1-18

  5. Schober, Isabel [VerfasserIn]; Bunk, Boyke [VerfasserIn]; Carril, Gabriela [VerfasserIn]; Freese, Heike M. [VerfasserIn]; Ojeda, Nicolás [VerfasserIn]; Riedel, Thomas [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Spröer, Cathrin [VerfasserIn]; Flores-Herrera, Patricio A. [VerfasserIn]; Nourdin-Galindo, Guillermo [VerfasserIn]; Gómez, Fernando [VerfasserIn]; Cárdenas, Constanza [VerfasserIn]; Vásquez-Ponce, Felipe [VerfasserIn]; Labra, Alvaro [VerfasserIn]; Figueroa, Jaime [VerfasserIn]; Olivares-Pacheco, Jorge [VerfasserIn]; Nübel, Ulrich [VerfasserIn]; Sikorski, Johannes [VerfasserIn]; Marshall, Sergio H. [VerfasserIn]; Overmann, Jörg [VerfasserIn]

    Ongoing diversification of the global fish pathogen Piscirickettsia salmonis through genetic isolation and transposition bursts

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2023

  6. Frentrup, Martinique [VerfasserIn]; Zhou, Zhemin [VerfasserIn]; Steglich, Matthias [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Riedel, Thomas [VerfasserIn]; Bunk, Boyke [VerfasserIn]; Spröer, Cathrin [VerfasserIn]; Overmann, Jörg [VerfasserIn]; Blaschitz, Marion [VerfasserIn]; Indra, Alexander [VerfasserIn]; von Müller, Lutz [VerfasserIn]; Kohl, Thomas A. [VerfasserIn]; Niemann, Stefan [VerfasserIn]; Seyboldt, Christian [VerfasserIn]; Klawonn, Frank [VerfasserIn]; Kumar, Nitin [VerfasserIn]; Lawley, Trevor D. [VerfasserIn]; García-Fernández, Sergio [VerfasserIn]; Cantón, Rafael [VerfasserIn]; del Campo, Rosa [VerfasserIn]; Zimmermann, Ortrud [VerfasserIn]; Groß, Uwe [VerfasserIn]; Achtman, Mark [VerfasserIn];

    A publicly accessible database for Clostridioides difficile genome sequences supports tracing of transmission chains and epidemics

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2020

  7. Carro, Lorena [VerfasserIn]; Nouioui, Imen [VerfasserIn]; Sangal, Vartul [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Trujillo, Martha E. [VerfasserIn]; Montero-Calasanz, Maria del Carmen [VerfasserIn]; Sahin, Nevzat [VerfasserIn]; Smith, Darren Lee [VerfasserIn]; Kim, Kristi E. [VerfasserIn]; Peluso, Paul [VerfasserIn]; Deshpande, Shweta [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Shapiro, Nicole [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Goodfellow, Michael [VerfasserIn]

    Genome-based classification of micromonosporae with a focus on their biotechnological and ecological potential

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2018

  8. Mukherjee, Supratim [VerfasserIn]; Seshadri, Rekha [VerfasserIn]; Varghese, Neha J. [VerfasserIn]; Eloe-Fadrosh, Emiley A. [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Coates, R. Cameron [VerfasserIn]; Hadjithomas, Michalis [VerfasserIn]; Pavlopoulos, Georgios A. [VerfasserIn]; Paez-Espino, David [VerfasserIn]; Yoshikuni, Yasuo [VerfasserIn]; Visel, Axel [VerfasserIn]; Whitman, William B. [VerfasserIn]; Garrity, George M. [VerfasserIn]; Eisen, Jonathan A. [VerfasserIn]; Hugenholtz, Philip [VerfasserIn]; Pati, Amrita [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia N. [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]

    1,003 reference genomes of bacterial and archaeal isolates expand coverage of the tree of life

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2017

  9. Panschin, Irina [VerfasserIn]; Huang, Sixing [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Tindall, Brian J. [VerfasserIn]; Rohde, Manfred [VerfasserIn]; Verbarg, Susanne [VerfasserIn]; Lapidus, Alla [VerfasserIn]; Han, James [VerfasserIn]; Trong, Stephan [VerfasserIn]; Haynes, Matthew [VerfasserIn]; Reddy, T. B. K. [VerfasserIn]; Huntemann, Marcel [VerfasserIn]; Pati, Amrita [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia N. [VerfasserIn]; Mavromatis, Konstantinos [VerfasserIn]; Markowitz, Victor [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Hahnke, Richard L. [VerfasserIn]

    Comparing polysaccharide decomposition between the type strains Gramella echinicola KMM 6050T (DSM 19838T) and Gramella portivictoriae UST040801-001T (DSM 23547T), and emended description of Gramella echinicola Nedashkovskaya et al. 2005 emend. Shahina et al. 2014 and Gramella portivictoriae Lau et al. 2005

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2016

  10. Tashkandy, Nisreen [VerfasserIn]; Sabban, Sari [VerfasserIn]; Fakieh, Mohammad [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Huang, Sixing [VerfasserIn]; Tindall, Brian J. [VerfasserIn]; Rohde, Manfred [VerfasserIn]; Baeshen, Mohammed N. [VerfasserIn]; Baeshen, Nabih A. [VerfasserIn]; Lapidus, Alla [VerfasserIn]; Copeland, Alex [VerfasserIn]; Pillay, Manoj [VerfasserIn]; Reddy, T. B. K. [VerfasserIn]; Huntemann, Marcel [VerfasserIn]; Pati, Amrita [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia [VerfasserIn]; Markowitz, Victor [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Hahnke, Richard L. [VerfasserIn]

    High-quality draft genome sequence of Flavobacterium suncheonense GH29-5T (DSM 17707T) isolated from greenhouse soil in South Korea, and emended description of Flavobacterium suncheonense GH29-5T

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2016

  11. Hahnke, Richard L. [VerfasserIn]; Stackebrandt, Erko [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Tindall, Brian J. [VerfasserIn]; Huang, Sixing [VerfasserIn]; Rohde, Manfred [VerfasserIn]; Lapidus, Alla [VerfasserIn]; Han, James [VerfasserIn]; Trong, Stephan [VerfasserIn]; Haynes, Matthew [VerfasserIn]; Reddy, T. B. K. [VerfasserIn]; Huntemann, Marcel [VerfasserIn]; Pati, Amrita [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia N. [VerfasserIn]; Mavromatis, Konstantinos [VerfasserIn]; Markowitz, Victor [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]

    High quality draft genome sequence of Flavobacterium rivuli type strain WB 3.3-2T (DSM 21788T), a valuable source of polysaccharide decomposing enzymes

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2015

  12. Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Hahnke, Richard L. [VerfasserIn]; Petersen, Jörn [VerfasserIn]; Scheuner, Carmen [VerfasserIn]; Michael, Victoria [VerfasserIn]; Fiebig, Anne [VerfasserIn]; Rohde, Christine [VerfasserIn]; Rohde, Manfred [VerfasserIn]; Fartmann, Berthold [VerfasserIn]; Goodwin, Lynne A. [VerfasserIn]; Chertkov, Olga [VerfasserIn]; Reddy, T. B. K. [VerfasserIn]; Pati, Amrita [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia N. [VerfasserIn]; Markowitz, Victor [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]

    Complete genome sequence of DSM 30083T, the type strain (U5/41T) of Escherichia coli, and a proposal for delineating subspecies in microbial taxonomy

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2014

  13. Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Lu, Megan [VerfasserIn]; Huntemann, Marcel [VerfasserIn]; Lucas, Susan [VerfasserIn]; Lapidus, Alla [VerfasserIn]; Copeland, Alex [VerfasserIn]; Pitluck, Sam [VerfasserIn]; Goodwin, Lynne A. [VerfasserIn]; Han, Cliff [VerfasserIn]; Tapia, Roxanne [VerfasserIn]; Pötter, Gabriele [VerfasserIn]; Land, Miriam [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia [VerfasserIn]; Rohde, Manfred [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; Detter, John C. [VerfasserIn]; Woyke, Tanja [VerfasserIn]; Kyrpides, Nikos C. [VerfasserIn]; Klenk, Hans-Peter [VerfasserIn]

    Genome sequence of the chemoheterotrophic soil bacterium Saccharomonospora cyanea type strain (NA-134T)

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2013

  14. Palaniappan, Krishna [VerfasserIn]; Meier-Kolthoff, Jan P. [VerfasserIn]; Teshima, Hazuki [VerfasserIn]; Nolan, Matt [VerfasserIn]; Lapidus, Alla [VerfasserIn]; Tice, Hope [VerfasserIn]; Del Rio, Tijana Glavina [VerfasserIn]; Cheng, Jan-Fang [VerfasserIn]; Han, Cliff [VerfasserIn]; Tapia, Roxanne [VerfasserIn]; Goodwin, Lynne A. [VerfasserIn]; Pitluck, Sam [VerfasserIn]; Liolios, Konstantinos [VerfasserIn]; Mavromatis, Konstantinos [VerfasserIn]; Pagani, Ioanna [VerfasserIn]; Ivanova, Natalia [VerfasserIn]; Mikhailova, Natalia [VerfasserIn]; Pati, Amrita [VerfasserIn]; Chen, Amy [VerfasserIn]; Rohde, Manfred [VerfasserIn]; Mayilraj, Shanmugam [VerfasserIn]; Spring, Stefan [VerfasserIn]; Detter, John C. [VerfasserIn]; Göker, Markus [VerfasserIn]; [...]

    Genome sequence of the moderately thermophilic sulfur-reducing bacterium Thermanaerovibrio velox type strain (Z-9701T) and emended description of the genus Thermanaerovibrio

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    Augsburg University Publication Server (OPUS), 2013