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  1. Schlesner, Matthias [VerfasserIn]; Eils, Jürgen [VerfasserIn] ; Eils, Roland [MitwirkendeR] Universitätsbibliothek Heidelberg

    Projekttitel: Charakterisierung des nicht-Protein-kodierenden Subgenoms in Tumorzellen durch Mining genomweiter Omics-Datensätze aus den deutschen ICGC Projekten : Schlussbericht : Teilprojekt 1: Arbeitspakete 4, 7 : Teilprojekt 2: Arbeitspaket 6 : Teilprojekt 3: Arbeitspakete 6, 7 = Final report on the BMBF funded project: ICGC-DE-Mining - characterization of the non-coding genome in tumor cells by genome-wide mining of omics datasets from the german ICGC projects for the University of Heidelberg (subproject 1: wp 4,7; subproject 2: wp 6; subproject 3: wp 6, 7)

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    [Heidelberg]: Universität Heidelberg, [2018?]

  3. Hovestadt, Volker [VerfasserIn]; Jones, David T. W. [VerfasserIn]; Kool, Marcel [VerfasserIn]; Bartholomä, Cynthia C. [VerfasserIn]; Kalle, Christof von [VerfasserIn]; Eils, Jürgen [VerfasserIn]; Milde, Till [VerfasserIn]; Witt, Olaf [VerfasserIn]; Scheurlen, Wolfram [VerfasserIn]; Brors, Benedikt [VerfasserIn]; Eils, Roland [VerfasserIn]; Korshunov, Andrey [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]; Pfister, Stefan [VerfasserIn]; Lichter, Peter [VerfasserIn]

    Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing

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    2014

    Erschienen in: Nature <London> ; 510(2014), 7506, Seite 537-541

  4. Jones, David T. W. [VerfasserIn]; Jäger, Natalie [VerfasserIn]; Kool, Marcel [VerfasserIn]; Zichner, Thomas [VerfasserIn]; Hutter, Barbara [VerfasserIn]; Sultan, Marc [VerfasserIn]; Cho, Yoon-Jae [VerfasserIn]; Pugh, Trevor [VerfasserIn]; Hovestadt, Volker [VerfasserIn]; Stütz, Adrian M. [VerfasserIn]; Rausch, Tobias [VerfasserIn]; Warnatz, Hans-Jörg [VerfasserIn]; Ryzhova, Marina [VerfasserIn]; Bender, Sebastian [VerfasserIn]; Sturm, Dominik [VerfasserIn]; Pleier, Sabrina Valesca [VerfasserIn]; Şeker-Cin, Huriye [VerfasserIn]; Pfaff, Elke [VerfasserIn]; Sieber, Laura [VerfasserIn]; Wittmann, Andrea [VerfasserIn]; Remke, Marc [VerfasserIn]; Witt, Hendrik [VerfasserIn]; Hutter, Sonja [VerfasserIn]; Tzaridis, Theophilos-Dimitrios [VerfasserIn]; [...]

    Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma

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    25 July 2012

    Erschienen in: Nature <London> ; 488(2012), 7409, Seite 100-105

  5. Schulte, Johannes H; Schramm, Alexander; Klein-Hitpass, Ludger; Klenk, Michael; Wessels, Hendrika; Hauffa, Berthold P; Eils, Jürgen; Eils, Roland; Brodeur, Garrett M; Schweigerer, Lothar; Havers, Werner; Eggert, Angelika

    Microarray analysis reveals differential gene expression patterns and regulation of single target genes contributing to the opposing phenotype of TrkA- and TrkB-expressing neuroblastomas

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    Springer Science and Business Media LLC, 2005

    Erschienen in: Oncogene

  6. Schramm, Alexander; Schulte, Johannes H; Klein-Hitpass, Ludger; Havers, Werner; Sieverts, Hauke; Berwanger, Bernd; Christiansen, Holger; Warnat, Patrick; Brors, Benedikt; Eils, Jürgen; Eils, Roland; Eggert, Angelika

    Prediction of clinical outcome and biological characterization of neuroblastoma by expression profiling

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    Springer Science and Business Media LLC, 2005

    Erschienen in: Oncogene

  8. Mayer, Gerhard; Müller, Wolfgang; Schork, Karin; Uszkoreit, Julian; Weidemann, Andreas; Wittig, Ulrike; Rey, Maja; Quast, Christian; Felden, Janine; Glöckner, Frank Oliver; Lange, Matthias; Arend, Daniel; Beier, Sebastian; Junker, Astrid; Scholz, Uwe; Schüler, Danuta; Kestler, Hans A; Wibberg, Daniel; Pühler, Alfred; Twardziok, Sven; Eils, Jürgen; Eils, Roland; Hoffmann, Steve; Eisenacher, Martin;

    Implementing FAIR data management within the German Network for Bioinformatics Infrastructure (de.NBI) exemplified by selected use cases

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    Oxford University Press (OUP), 2021

    Erschienen in: Briefings in Bioinformatics

  9. Glont, Mihai; Nguyen, Tung V N; Graesslin, Martin; Hälke, Robert; Ali, Raza; Schramm, Jochen; Wimalaratne, Sarala M; Kothamachu, Varun B; Rodriguez, Nicolas; Swat, Maciej J; Eils, Jurgen; Eils, Roland; Laibe, Camille; Malik-Sheriff, Rahuman S; Chelliah, Vijayalakshmi; Le Novère, Nicolas; Hermjakob, Henning

    BioModels: expanding horizons to include more modelling approaches and formats

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    Oxford University Press (OUP), 2018

    Erschienen in: Nucleic Acids Research

  10. Ishaque, Naveed; Abba, Mohammed L.; Hauser, Christine; Patil, Nitin; Paramasivam, Nagarajan; Huebschmann, Daniel; Leupold, Jörg Hendrik; Balasubramanian, Gnana Prakash; Kleinheinz, Kortine; Toprak, Umut H.; Hutter, Barbara; Benner, Axel; Shavinskaya, Anna; Zhou, Chan; Gu, Zuguang; Kerssemakers, Jules; Marx, Alexander; Moniuszko, Marcin; Kozlowski, Miroslaw; Reszec, Joanna; Niklinski, Jacek; Eils, Jürgen; Schlesner, Matthias; Eils, Roland; [...]

    Whole genome sequencing puts forward hypotheses on metastasis evolution and therapy in colorectal cancer

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: Nature Communications

  11. Borchert, Florian; Mock, Andreas; Tomczak, Aurelie; Hügel, Jonas; Alkarkoukly, Samer; Knurr, Alexander; Volckmar, Anna-Lena; Stenzinger, Albrecht; Schirmacher, Peter; Debus, Jürgen; Jäger, Dirk; Longerich, Thomas; Fröhling, Stefan; Eils, Roland; Bougatf, Nina; Sax, Ulrich; Schapranow, Matthieu-P

    Knowledge bases and software support for variant interpretation in precision oncology

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    Oxford University Press (OUP), 2021

    Erschienen in: Briefings in Bioinformatics

  12. Borchert, Florian; Mock, Andreas; Tomczak, Aurelie; Hügel, Jonas; Alkarkoukly, Samer; Knurr, Alexander; Volckmar, Anna-Lena; Stenzinger, Albrecht; Schirmacher, Peter; Debus, Jürgen; Jäger, Dirk; Longerich, Thomas; Fröhling, Stefan; Eils, Roland; Bougatf, Nina; Sax, Ulrich; Schapranow, Matthieu-P

    Knowledge bases and software support for variant interpretation in precision oncology

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    Oxford University Press (OUP), 2021

    Erschienen in: Briefings in Bioinformatics

  13. Chua, Robert Lorenz; Lukassen, Soeren; Trump, Saskia; Hennig, Bianca P.; Wendisch, Daniel; Pott, Fabian; Debnath, Olivia; Thürmann, Loreen; Kurth, Florian; Völker, Maria Theresa; Kazmierski, Julia; Timmermann, Bernd; Twardziok, Sven; Schneider, Stefan; Machleidt, Felix; Müller-Redetzky, Holger; Maier, Melanie; Krannich, Alexander; Schmidt, Sein; Balzer, Felix; Liebig, Johannes; Loske, Jennifer; Suttorp, Norbert; Eils, Jürgen; [...]

    COVID-19 severity correlates with airway epithelium–immune cell interactions identified by single-cell analysis

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    Springer Science and Business Media LLC, 2020

    Erschienen in: Nature Biotechnology

  14. Bosquillon de Jarcy, Laure; Akbil, Bengisu; Mhlekude, Baxolele; Leyens, Johanna; Postmus, Dylan; Harnisch, Greta; Jansen, Jenny; Schmidt, Marie L.; Aigner, Annette; Pott, Fabian; Chua, Robert Lorenz; Krist, Lilian; Gentile, Roberta; Mühlemann, Barbara; Jones, Terence C.; Niemeyer, Daniela; Fricke, Julia; Keil, Thomas; Pischon, Tobias; Janke, Jürgen; Conrad, Christian; Iacobelli, Stefano; Drosten, Christian; Corman, Victor M.; [...]

    90K/LGALS3BP expression is upregulated in COVID-19 but may not restrict SARS-CoV-2 infection

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Clinical and Experimental Medicine

  15. Sommer, Kim K.; Amr, Ali; Bavendiek, Udo; Beierle, Felix; Brunecker, Peter; Dathe, Henning; Eils, Jürgen; Ertl, Maximilian; Fette, Georg; Gietzelt, Matthias; Heidecker, Bettina; Hellenkamp, Kristian; Heuschmann, Peter; Hoos, Jennifer D. E.; Kesztyüs, Tibor; Kerwagen, Fabian; Kindermann, Aljoscha; Krefting, Dagmar; Landmesser, Ulf; Marschollek, Michael; Meder, Benjamin; Merzweiler, Angela; Prasser, Fabian; Pryss, Rüdiger; [...]

    Structured, Harmonized, and Interoperable Integration of Clinical Routine Data to Compute Heart Failure Risk Scores

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    MDPI AG, 2022

    Erschienen in: Life

  16. Behjati Ardakani, Fatemeh; Kattler, Kathrin; Nordström, Karl; Gasparoni, Nina; Gasparoni, Gilles; Fuchs, Sarah; Sinha, Anupam; Barann, Matthias; Ebert, Peter; Fischer, Jonas; Hutter, Barbara; Zipprich, Gideon; Imbusch, Charles D.; Felder, Bärbel; Eils, Jürgen; Brors, Benedikt; Lengauer, Thomas; Manke, Thomas; Rosenstiel, Philip; Walter, Jörn; Schulz, Marcel H.

    Integrative analysis of single-cell expression data reveals distinct regulatory states in bidirectional promoters

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: Epigenetics & Chromatin

  17. Schmidt, Florian; Gasparoni, Nina; Gasparoni, Gilles; Gianmoena, Kathrin; Cadenas, Cristina; Polansky, Julia K.; Ebert, Peter; Nordström, Karl; Barann, Matthias; Sinha, Anupam; Fröhler, Sebastian; Xiong, Jieyi; Dehghani Amirabad, Azim; Behjati Ardakani, Fatemeh; Hutter, Barbara; Zipprich, Gideon; Felder, Bärbel; Eils, Jürgen; Brors, Benedikt; Chen, Wei; Hengstler, Jan G.; Hamann, Alf; Lengauer, Thomas; Rosenstiel, Philip; [...]

    Combining transcription factor binding affinities with open-chromatin data for accurate gene expression prediction

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    Oxford University Press (OUP), 2017

    Erschienen in: Nucleic Acids Research

  18. Spanagel, Rainer; Bartsch, Dusan; Brors, Bendikt; Dahmen, Norbert; Deussing, Jan; Eils, Roland; Ende, Gabriele; Gallinat, Jürgen; Gebicke‐Haerter, Peter; Heinz, Andreas; Kiefer, Falk; Jäger, Willi; Mann, Karl; Matthäus, Franziska; Nöthen, Markus; Rietschel, Marcella; Sartorius, Alexander; Schütz, Günther; Sommer, Wolfgang H.; Sprengel, Rolf; Walter, Henrik; Wichmann, Erich; Wienker, Thomas; Wurst, Wolfgang;

    An integrated genome research network for studying the genetics of alcohol addiction

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    Wiley, 2010

    Erschienen in: Addiction Biology

  19. Justenhoven, Christina; Hamann, Ute; Schubert, Falk; Zapatka, Marc; Pierl, Christiane B.; Rabstein, Sylvia; Selinski, Silvia; Mueller, Tina; Ickstadt, Katja; Gilbert, Michael; Ko, Yon-Dschun; Baisch, Christian; Pesch, Beate; Harth, Volker; Bolt, Hermann M.; Vollmert, Caren; Illig, Thomas; Eils, Roland; Dippon, Jürgen; Brauch, Hiltrud

    Breast cancer: a candidate gene approach across the estrogen metabolic pathway

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    Springer Science and Business Media LLC, 2008

    Erschienen in: Breast Cancer Research and Treatment

  20. Trump, Saskia; Lukassen, Soeren; Anker, Markus S.; Chua, Robert Lorenz; Liebig, Johannes; Thürmann, Loreen; Corman, Victor Max; Binder, Marco; Loske, Jennifer; Klasa, Christina; Krieger, Teresa; Hennig, Bianca P.; Messingschlager, Marey; Pott, Fabian; Kazmierski, Julia; Twardziok, Sven; Albrecht, Jan Philipp; Eils, Jürgen; Hadzibegovic, Sara; Lena, Alessia; Heidecker, Bettina; Bürgel, Thore; Steinfeldt, Jakob; Goffinet, Christine; [...]

    Hypertension delays viral clearance and exacerbates airway hyperinflammation in patients with COVID-19

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    Springer Science and Business Media LLC, 2021

    Erschienen in: Nature Biotechnology