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  1. Dyczynski, Matheus; Vesterlund, Mattias; Björklund, Ann-Charlotte; Zachariadis, Vasilios; Janssen, Jerry; Gallart-Ayala, Hector; Daskalaki, Evangelia; Wheelock, Craig E.; Lehtiö, Janne; Grandér, Dan; Tamm, Katja Pokrovskaja; Nilsson, Roland

    Metabolic reprogramming of acute lymphoblastic leukemia cells in response to glucocorticoid treatment

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: Cell Death & Disease

  2. Zhu, Yafeng; Orre, Lukas M.; Johansson, Henrik J.; Huss, Mikael; Boekel, Jorrit; Vesterlund, Mattias; Fernandez-Woodbridge, Alejandro; Branca, Rui M. M.; Lehtiö, Janne

    Publisher Correction: Discovery of coding regions in the human genome by integrated proteogenomics analysis workflow

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: Nature Communications

  3. Nassa, Giovanni; Giurato, Giorgio; Cimmino, Giovanni; Rizzo, Francesca; Ravo, Maria; Salvati, Annamaria; Nyman, Tuula A.; Zhu, Yafeng; Vesterlund, Mattias; Lehtiö, Janne; Golino, Paolo; Weisz, Alessandro; Tarallo, Roberta

    Splicing of platelet resident pre-mRNAs upon activation by physiological stimuli results in functionally relevant proteome modifications

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    Springer Science and Business Media LLC, 2018

    Erschienen in: Scientific Reports

  4. Zadjali, Fahad; Pike, Ashley C.W.; Vesterlund, Mattias; Sun, Jianmin; Wu, Chenggang; Li, Shawn S.C.; Rönnstrand, Lars; Knapp, Stefan; Bullock, Alex N.; Flores-Morales, Amilcar

    Structural Basis for c-KIT Inhibition by the Suppressor of Cytokine Signaling 6 (SOCS6) Ubiquitin Ligase

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    Elsevier BV, 2011

    Erschienen in: Journal of Biological Chemistry

  5. Trac, Quang Thinh; Pawitan, Yudi; Mou, Tian; Erkers, Tom; Östling, Päivi; Bohlin, Anna; Österroos, Albin; Vesterlund, Mattias; Jafari, Rozbeh; Siavelis, Ioannis; Bäckvall, Helena; Kiviluoto, Santeri; Orre, Lukas M.; Rantalainen, Mattias; Lehtiö, Janne; Lehmann, Sören; Kallioniemi, Olli; Vu, Trung Nghia

    Prediction model for drug response of acute myeloid leukemia patients

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: npj Precision Oncology

  6. Struyf, Nona; Österroos, Albin; Vesterlund, Mattias; Arnroth, Cornelia; James, Tojo; Sunandar, Stephanie; Mermelekas, Georgios; Bohlin, Anna; Hamberg Levedahl, Kerstin; Bengtzén, Sofia; Jafari, Rozbeh; Orre, Lukas M.; Lehtiö, Janne; Lehmann, Sören; Östling, Päivi; Kallioniemi, Olli; Seashore-Ludlow, Brinton; Erkers, Tom

    Delineating functional and molecular impact of ex vivo sample handling in precision medicine

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    Springer Science and Business Media LLC, 2024

    Erschienen in: npj Precision Oncology

  7. Erkers, Tom; Struyf, Nona; James, Tojo; Marabita, Francesco; Vesterlund, Mattias; Vu, Nghia; Arnroth, Cornelia; Österroos, Albin; Bohlin, Anna; Bengtzén, Sofia; Stahl, Matthias; Jafari, Rozbeh; Orre, Lukas; Pawitan, Yudi; Seashore-Ludlow, Brinton; Lehtiö, Janne; Lehmann, Sören; Östling, Päivi; Kallioniemi, Olli

    Abstract 6612: Data-driven hallmarks of cancer as a new paradigm for precision medicine: multi-omics and functional profiling in acute myeloid leukemia

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    American Association for Cancer Research (AACR), 2023

    Erschienen in: Cancer Research

  8. Erkers, Tom; Marabita, Francesco; Struyf, Nona; Vesterlund, Mattias; James, Tojo; Arnroth, Cornelia; Bohlin, Anna; Bengtzén, Sofia; Österroos, Albin; Stahl, Matthias; Jafari, Rozbeh; Orre, Lukas; Pawitan, Yudi; Seashore-Ludlow, Brinton; Lehtiö, Janne; Lehmann, Sören; Östling, Päivi; Kallioniemi, Olli

    Data-Driven Molecular Hallmarks of Acute Myeloid Leukemia: Biological, Prognostic and Therapeutic Implications

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    American Society of Hematology, 2022

    Erschienen in: Blood

  9. Leo, Isabelle Rose; Aswad, Luay; Stahl, Matthias; Kunold, Elena; Post, Frederik; Erkers, Tom; Struyf, Nona; Mermelekas, Georgios; Joshi, Rubin Narayan; Gracia-Villacampa, Eva; Östling, Päivi; Kallioniemi, Olli P.; Tamm, Katja Pokrovskaja; Siavelis, Ioannis; Lehtiö, Janne; Vesterlund, Mattias; Jafari, Rozbeh

    Integrative multi-omics and drug response profiling of childhood acute lymphoblastic leukemia cell lines

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications

  10. Gao, Yu; Liu, Ruining; He, Chenfei; Basile, Juan; Vesterlund, Mattias; Wahren-Herlenius, Marie; Espinoza, Alexander; Hokka-Zakrisson, Cassandra; Zadjali, Fahad; Yoshimura, Akihiko; Karlsson, Mikael; Carow, Berit; Rottenberg, Martin E.

    SOCS3 Expression by Thymic Stromal Cells Is Required for Normal T Cell Development

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    Frontiers Media SA, 2021

    Erschienen in: Frontiers in Immunology

  11. Yang, Minjun; Vesterlund, Mattias; Siavelis, Ioannis; Moura-Castro, Larissa H.; Castor, Anders; Fioretos, Thoas; Jafari, Rozbeh; Lilljebjörn, Henrik; Odom, Duncan T.; Olsson, Linda; Ravi, Naveen; Woodward, Eleanor L.; Harewood, Louise; Lehtiö, Janne; Paulsson, Kajsa

    Proteogenomics and Hi-C reveal transcriptional dysregulation in high hyperdiploid childhood acute lymphoblastic leukemia

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    Springer Science and Business Media LLC, 2019

    Erschienen in: Nature Communications

  12. Zadjali, Fahad; Santana‐Farre, Ruyman; Vesterlund, Mattias; Carow, Berit; Mirecki‐Garrido, Mercedes; Hernandez‐Hernandez, Irene; Flodström‐Tullberg, Malin; Parini, Paolo; Rottenberg, Martin; Norstedt, Gunnar; Fernandez‐Perez, Leandro; Flores‐Morales, Amilcar

    SOCS2 deletion protects against hepatic steatosis but worsens insulin resistance in high‐fat‐diet‐fed mice

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    Wiley, 2012

    Erschienen in: The FASEB Journal

  13. Stratmann, Svea; Vesterlund, Mattias; Umer, Husen M.; Eshtad, Saeed; Skaftason, Aron; Herlin, Morten Krogh; Sundström, Christer; Eriksson, Anna; Höglund, Martin; Palle, Josefine; Abrahamsson, Jonas; Jahnukainen, Kirsi; Munthe-Kaas, Monica Cheng; Zeller, Bernward; Tamm, Katja Pokrovskaja; Lindskog, Cecilia; Cavelier, Lucia; Lehtiö, Janne; Holmfeldt, Linda

    Proteogenomic analysis of acute myeloid leukemia associates relapsed disease with reprogrammed energy metabolism both in adults and children

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    Springer Science and Business Media LLC, 2023

    Erschienen in: Leukemia

  14. Mou, Tian; Pawitan, Yudi; Stahl, Matthias; Vesterlund, Mattias; Deng, Wenjiang; Jafari, Rozbeh; Bohlin, Anna; Österroos, Albin; Siavelis, Loannis; Bäckvall, Helena; Erkers, Tom; Kiviluoto, Santeri; Seashore‐Ludlow, Brinton; Östling, Päivi; Orre, Lukas M.; Kallioniemi, Olli; Lehmann, Sören; Lehtiö, Janne; Vu, Trung Nghia

    The transcriptome‐wide landscape of molecular subtype‐specific mRNA expression profiles in acute myeloid leukemia

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    Wiley, 2021

    Erschienen in: American Journal of Hematology

  15. Matic, Ljubica Perisic; Jesus Iglesias, Maria; Vesterlund, Mattias; Lengquist, Mariette; Hong, Mun-Gwan; Saieed, Shanga; Sanchez-Rivera, Laura; Berg, Martin; Razuvaev, Anton; Kronqvist, Malin; Lund, Kent; Caidahl, Kenneth; Gillgren, Peter; Pontén, Fredrik; Uhlén, Mathias; Schwenk, Jochen M.; Hansson, Göran K.; Paulsson-Berne, Gabrielle; Fagman, Erika; Roy, Joy; Hultgren, Rebecka; Bergström, Göran; Lehtiö, Janne; Odeberg, Jacob;

    Novel Multiomics Profiling of Human Carotid Atherosclerotic Plaques and Plasma Reveals Biliverdin Reductase B as a Marker of Intraplaque Hemorrhage

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    Elsevier BV, 2018

    Erschienen in: JACC: Basic to Translational Science

  16. Anderson, Johnathon D.; Johansson, Henrik J.; Graham, Calvin S.; Vesterlund, Mattias; Pham, Missy T.; Bramlett, Charles S.; Montgomery, Elizabeth N.; Mellema, Matt S.; Bardini, Renee L.; Contreras, Zelenia; Hoon, Madeline; Bauer, Gerhard; Fink, Kyle D.; Fury, Brian; Hendrix, Kyle J.; Chedin, Frederic; EL-Andaloussi, Samir; Hwang, Billie; Mulligan, Michael S.; Lehtiö, Janne; Nolta, Jan A.

    Comprehensive Proteomic Analysis of Mesenchymal Stem Cell Exosomes Reveals Modulation of Angiogenesis via Nuclear Factor-KappaB Signaling

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    Oxford University Press (OUP), 2016

    Erschienen in: Stem Cells

  17. Rykaczewska, Urszula; Suur, Bianca E.; Röhl, Samuel; Razuvaev, Anton; Lengquist, Mariette; Sabater-Lleal, Maria; van der Laan, Sander W.; Miller, Clint L.; Wirka, Robert C.; Kronqvist, Malin; Gonzalez Diez, Maria; Vesterlund, Mattias; Gillgren, Peter; Odeberg, Jacob; Lindeman, Jan H.; Veglia, Fabrizio; Humphries, Steve E.; de Faire, Ulf; Baldassarre, Damiano; Tremoli, Elena; Lehtiö, Janne; Hansson, Göran K.; Paulsson-Berne, Gabrielle; Pasterkamp, Gerard; [...]

    PCSK6 Is a Key Protease in the Control of Smooth Muscle Cell Function in Vascular Remodeling

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    Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health), 2020

    Erschienen in: Circulation Research

  18. Herbst, Sophie A.; Vesterlund, Mattias; Jafari, Rozbeh; Siavelis, Ioannis; Stahl, Matthias; Schitter, Eva; Helmboldt, Alexander J.; Iskar, Murat; Liebers, Nora; Czernilofsky, Felix; Roider, Tobias; Bruch, Peter-Martin; Lu, Junyan; Richter, Sarah; Mermelekas, Georgios; Umer, Husen Muhammad; Knoll, Mareike; Kolb, Carolin; Lenze, Angela; Cao, Xiaofang; Österholm-Corbascio, Cecilia; Scheinost, Sebastian; Ganzinger, Matthias; Mansouri, Larry; [...]

    Proteogenomic Subtyping of Chronic Lymphocytic Leukemia Identifies a Novel Poor Outcome Subgroup with a Distinct Drug Response Profile

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    American Society of Hematology, 2020

    Erschienen in: Blood

  19. Perisic Matic, Ljubica; Rykaczewska, Urszula; Razuvaev, Anton; Sabater-Lleal, Maria; Lengquist, Mariette; Miller, Clint L.; Ericsson, Ida; Röhl, Samuel; Kronqvist, Malin; Aldi, Silvia; Magné, Joelle; Paloschi, Valentina; Vesterlund, Mattias; Li, Yuhuang; Jin, Hong; Diez, Maria Gonzalez; Roy, Joy; Baldassarre, Damiano; Veglia, Fabrizio; Humphries, Steve E.; de Faire, Ulf; Tremoli, Elena; Odeberg, Jacob; Vukojević, Vladana; [...]

    Phenotypic Modulation of Smooth Muscle Cells in Atherosclerosis Is Associated With Downregulation of LMOD1, SYNPO2, PDLIM7, PLN , and SYNM

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    Ovid Technologies (Wolters Kluwer Health), 2016

    Erschienen in: Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology

  20. Herbst, Sophie A.; Vesterlund, Mattias; Helmboldt, Alexander J.; Jafari, Rozbeh; Siavelis, Ioannis; Stahl, Matthias; Schitter, Eva C.; Liebers, Nora; Brinkmann, Berit J.; Czernilofsky, Felix; Roider, Tobias; Bruch, Peter-Martin; Iskar, Murat; Kittai, Adam; Huang, Ying; Lu, Junyan; Richter, Sarah; Mermelekas, Georgios; Umer, Husen Muhammad; Knoll, Mareike; Kolb, Carolin; Lenze, Angela; Cao, Xiaofang; Österholm, Cecilia; [...]

    Proteogenomics refines the molecular classification of chronic lymphocytic leukemia

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications