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  2. Huang, Zhiqin [VerfasserIn]; Jones, David T. W. [VerfasserIn]; Lichter, Peter [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]

    confFuse : high-confidence fusion gene detection across tumor entities

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    29 September 2017

    Erschienen in: Frontiers in genetics ; 8(2017) Artikel-Nummer 137, 10 Seiten

  3. Schramm, Gunnar [VerfasserIn]; Oswald, Marcus [VerfasserIn]; Seitz, Hanna [VerfasserIn] ; Sager, Sebastian [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Zapatka, Marc [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Reinelt, Gerhard [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; Eils, Roland [Sonstige Person, Familie und Körperschaft]; König, Rainer [Sonstige Person, Familie und Körperschaft] Gesellschaft für Informatik Fachbereich Künstliche Intelligenz Fachgruppe Knowledge Discovery, Data Mining und Maschinelles Lernen (KDML)

    Pattern recognition of gene expression data on biochemical networks with simple wavelet transforms

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    Hildesheim, 2006

    Erschienen in: LWA 2006 ; (2006), Seite 350-355

  4. Gröbner, Susanne [VerfasserIn]; Jones, Barbara Christine [VerfasserIn]; Hettmer, Simone [VerfasserIn]; Niemeyer, Charlotte [VerfasserIn]; Chavez, Lukas [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]; Pfister, Stefan [VerfasserIn]

    The landscape of genomic alterations across childhood cancers

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    London [u.a.]: Nature Publ. Group, 2018

    Erschienen in: Nature <London> ; 555 (218), 321-327

  5. Koşaloğlu, Zeynep [VerfasserIn]; Bitzer, Julia [VerfasserIn]; Halama, Niels [VerfasserIn]; Huang, Zhiqin [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]; Schneeweiss, Andreas [VerfasserIn]; Jäger, Dirk [VerfasserIn]; Zörnig, Inka [VerfasserIn]

    In silico SNP analysis of the breast cancer antigen NY-BR-1

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    London; Berlin; Heidelberg: BioMed Central, 18 November 2016

  6. Wong, John K. L. [VerfasserIn]; Jassowicz, Lena [VerfasserIn]; Herold-Mende, Christel [VerfasserIn]; Seiffert, Martina [VerfasserIn]; Mallm, Jan-Philipp [VerfasserIn]; Lichter, Peter [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]

    scSNPdemux : a sensitive demultiplexing pipeline using single nucleotide polymorphisms for improved pooled single-cell RNA sequencing analysis

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    31 August 2023

    Erschienen in: BMC bioinformatics ; 24(2023), 1, Artikel-ID 326

  7. Plath, Michaela [VerfasserIn]; Gass, Johanna [VerfasserIn]; Hlevnjak, Mario [VerfasserIn]; Li, Qiaoli [VerfasserIn]; Feng, Bohai [VerfasserIn]; Hostench, Xavier Pastor [VerfasserIn]; Bieg, Matthias [VerfasserIn]; Schroeder, Lea [VerfasserIn]; Holzinger, Dana [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]; Freier, Kolja [VerfasserIn]; Weichert, Wilko [VerfasserIn]; Heß, Jochen [VerfasserIn]; Zaoui, Karim [VerfasserIn]

    Unraveling most abundant mutational signatures in head and neck cancer

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    2021

    Erschienen in: International journal of cancer ; 148(2021), 1, Seite 115-127

  8. Hovestadt, Volker [VerfasserIn]; Jones, David T. W. [VerfasserIn]; Kool, Marcel [VerfasserIn]; Bartholomä, Cynthia C. [VerfasserIn]; Kalle, Christof von [VerfasserIn]; Eils, Jürgen [VerfasserIn]; Milde, Till [VerfasserIn]; Witt, Olaf [VerfasserIn]; Scheurlen, Wolfram [VerfasserIn]; Brors, Benedikt [VerfasserIn]; Eils, Roland [VerfasserIn]; Korshunov, Andrey [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]; Pfister, Stefan [VerfasserIn]; Lichter, Peter [VerfasserIn]

    Decoding the regulatory landscape of medulloblastoma using DNA methylation sequencing

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    2014

    Erschienen in: Nature <London> ; 510(2014), 7506, Seite 537-541

  9. Hlevnjak, Mario [VerfasserIn]; Schulze, Markus [VerfasserIn]; Elgaafary, Shaymaa [VerfasserIn]; Fremd, Carlo [VerfasserIn]; Michel, Laura L. [VerfasserIn]; Beck, Katja [VerfasserIn]; Pfütze, Katrin [VerfasserIn]; Richter, Daniela [VerfasserIn]; Wolf, Stephan [VerfasserIn]; Horak, Peter [VerfasserIn]; Kreutzfeldt, Simon [VerfasserIn]; Pixberg, Constantin Frederic [VerfasserIn]; Hutter, Barbara [VerfasserIn]; Ishaque, Naveed [VerfasserIn]; Hirsch, Steffen [VerfasserIn]; Gieldon, Laura [VerfasserIn]; Stenzinger, Albrecht [VerfasserIn]; Springfeld, Christoph [VerfasserIn]; Smetanay, Katharina [VerfasserIn]; Seitz, Julia [VerfasserIn]; Mavratzas, Athanasios [VerfasserIn]; Brors, Benedikt [VerfasserIn]; Kirsten, Romy [VerfasserIn]; Schütz, Florian [VerfasserIn]; [...]

    CATCH : a prospective precision oncology trial in metastatic breast cancer

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    April 22, 2021

    Erschienen in: JCO precision oncology ; 5(2021), Seite 676-686

  10. Holmans, Peter [VerfasserIn]; Haenisch, Britta [VerfasserIn]; Giegling, Ina [VerfasserIn]; Ripke, Stephan [VerfasserIn]; Leber, Markus [VerfasserIn]; Lange, Christoph [VerfasserIn]; Schulze, Thomas G. [VerfasserIn]; Mössner, Rainald [VerfasserIn]; Nenadic, Igor [VerfasserIn]; Sauer, Heinrich [VerfasserIn]; Rujescu, Dan [VerfasserIn]; Maier, Wolfgang [VerfasserIn]; Zapatka, Marc [VerfasserIn]; Børglum, Anders [VerfasserIn]; Ophoff, Roel [VerfasserIn]; Cichon, Sven [VerfasserIn]; Nöthen, Markus M. [VerfasserIn]; Rietschel, Marcella [VerfasserIn]; Mattheisen, Manuel [VerfasserIn]; Brors, Benedikt [VerfasserIn]; Frank, Josef [VerfasserIn]; Witt, Stephanie H. [VerfasserIn]; Mühleisen, Thomas [VerfasserIn]; Treutlein, Jens [VerfasserIn]; [...]

    Integrated Pathway-Based Approach Identifies Association between Genomic Regions at CTCF and CACNB2 and Schizophrenia

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    Public Library of Science, 2014

    Erschienen in: PLoS Genetics 10(6), e1004345 (2014). doi:10.1371/journal.pgen.1004345

  11. Herbst, Sophie [VerfasserIn]; Vesterlund, Mattias [VerfasserIn]; Helmboldt, Alexander [VerfasserIn]; Jafari, Rozbeh [VerfasserIn]; Siavelis, Ioannis [VerfasserIn]; Stahl, Matthias [VerfasserIn]; Schitter, Eva C. [VerfasserIn]; Liebers, Nora [VerfasserIn]; Brinkmann, Berit J. [VerfasserIn]; Czernilofsky, Felix [VerfasserIn]; Roider, Tobias [VerfasserIn]; Bruch, Peter-Martin [VerfasserIn]; Iskar, Murat [VerfasserIn]; Kittai, Adam [VerfasserIn]; Huang, Ying [VerfasserIn]; Lu, Junyan [VerfasserIn]; Richter, Sarah [VerfasserIn]; Mermelekas, Georgios [VerfasserIn]; Umer, Husen Muhammad [VerfasserIn]; Knoll, Mareike [VerfasserIn]; Kolb, Carolin [VerfasserIn]; Lenze, Angela [VerfasserIn]; Cao, Xiaofang [VerfasserIn]; Österholm, Cecilia [VerfasserIn]; [...]

    Proteogenomics refines the molecular classification of chronic lymphocytic leukemia

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    20 October 2022

    Erschienen in: Nature Communications ; 13(2022) vom: Okt., Artikel-ID 6226, Seite 1-18

  12. Jones, David T. W. [VerfasserIn]; Jäger, Natalie [VerfasserIn]; Kool, Marcel [VerfasserIn]; Zichner, Thomas [VerfasserIn]; Hutter, Barbara [VerfasserIn]; Sultan, Marc [VerfasserIn]; Cho, Yoon-Jae [VerfasserIn]; Pugh, Trevor [VerfasserIn]; Hovestadt, Volker [VerfasserIn]; Stütz, Adrian M. [VerfasserIn]; Rausch, Tobias [VerfasserIn]; Warnatz, Hans-Jörg [VerfasserIn]; Ryzhova, Marina [VerfasserIn]; Bender, Sebastian [VerfasserIn]; Sturm, Dominik [VerfasserIn]; Pleier, Sabrina Valesca [VerfasserIn]; Şeker-Cin, Huriye [VerfasserIn]; Pfaff, Elke [VerfasserIn]; Sieber, Laura [VerfasserIn]; Wittmann, Andrea [VerfasserIn]; Remke, Marc [VerfasserIn]; Witt, Hendrik [VerfasserIn]; Hutter, Sonja [VerfasserIn]; Tzaridis, Theophilos-Dimitrios [VerfasserIn]; [...]

    Dissecting the genomic complexity underlying medulloblastoma

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    25 July 2012

    Erschienen in: Nature <London> ; 488(2012), 7409, Seite 100-105

  20. Wong, John K. L.; Aichmüller, Christian; Schulze, Markus; Hlevnjak, Mario; Elgaafary, Shaymaa; Lichter, Peter; Zapatka, Marc

    Association of mutation signature effectuating processes with mutation hotspots in driver genes and non-coding regions

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    Springer Science and Business Media LLC, 2022

    Erschienen in: Nature Communications