Titel:
Analyzing gene expression data with linear mixed models: applications to variable pool sizes and biomarkers
Beteiligte:
Rudolf, Henrik (gnd 1054537844)
[VerfasserIn]
Erschienen:
Universität Rostock Rostock, 2016 2016
Sprache:
Nicht zu entscheiden
DOI:
https://doi.org/10.18453/rosdok_id00001749
Entstehung:
Anmerkungen:
Diese Datenquelle enthält auch Bestandsnachweise, die nicht zu einem Volltext führen.
Beschreibung:
This work is about the design and statistical analysis of gene expression experiments with variable pool sizes. Conditions for unbiased contrasts in such experiments were derived. They were analyzed with linear mixed models, introducing a new type of variance component that accounts for unequal shares of individual samples in common pools. The relevance of this blending error variance was then investigated for four experimental data sets from different species. Finally a biomarker search for hygienic behavior in Apis mellifera workers was conducted, using nerve tissue gene expression data. ; Diese Arbeit behandelt Fragen der statistischen Planung und Auswertung von Genexpressionsexperimenten mit Mischproben (Pools) und variabler Zahl von individuellen Proben je Pool (Poolgröße). Eine Bedingung für die Verzerrungsfreiheit von Kontrasten im linearen Modell wurde abgeleitet. Die Relevanz der zur Auswertung mit gemischten linearen Modellen eingeführten Mischungsvarianz zeigte sich auch in experimentellen Daten. Eine Biomarkersuche für das individuelle Hygieneverhalten von Arbeiterinnen der Honigbiene leistet einen methodischen Beitrag zur Zucht von Varroa-resistenten Bienenvölkern.